临床医学的主要学科方向包括内科学、外科学、儿科学、老年医学、神经病学、精神病与精神卫生学、皮肤病与性病学、影像医学与核医学、临床检验诊断学、妇产科学、眼科学、耳鼻咽喉—头颈外科学、肿瘤学、康复医学与理疗学、运动医学、麻醉学、急诊医学和疼痛医学等。

1.内科学 主要研究人体各个系统(不含神经系统)的以药物治疗为主要疗法的各种疾病的病因、发病机制、临床表现、诊断、治疗与预防，是临床医学的基础学科。根据疾病系统，内科学分成心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病和感染病学等研究方向。

2.外科学  主要研究损伤、感染、肿瘤、畸形及其他性质的一般以手术或手法为主要疗法的疾病的诊断、预防、治疗、发生和发展规律。包括普通外科学、骨外科学、泌尿外科学、胸心外科学、神经外科学、整形外科学、烧伤科学、野战外科学等研究方向。

3.儿科学 主要研究新生儿、婴幼儿、儿童和青少年时期的疾病和健康问题。儿科学的主要研究方向以系统划分为呼吸、消化、循环、神经、血液、肾脏、内分泌等，小儿外科、感染性疾病（包括传染病）、急救医学、儿童保健、免疫性疾病、新生儿疾病、寄生虫病和遗传性疾病等也是儿科学重要的研究方向。

4.老年医学  主要研究老年病以及涉及人类衰老的基础理论研究，以及老年医学教育的研究，包括老年基础医学、老年临床医学、老年流行病学、老年预防医学和老年社会医学等。

5.神经病学  主要研究中枢神经系统、周围神经系统及骨骼肌疾病的病因及发病机制、病理、临床表现、诊断、治疗及预防的一门临床医学学科。神经病学主要研究方向包括血管性疾病（脑出血、脑梗死、蛛网膜下腔出血、颈动脉狭窄、颅内动脉狭窄等）、中枢神经系统感染性疾病、肿瘤、外伤、变性疾病、自身免疫性疾病、遗传性疾病、中毒性疾病、先天发育异常、营养缺陷、代谢障碍性疾病及各种神经内科疑难杂症。

6.精神病与精神卫生学 主要研究各种精神障碍的病因、发病机制、临床表现、发展规律、治疗以及康复的一门临床医学，研究内容包括生物学研究和社会学研究，如生物遗传学、神经化学、精神药理学、电生理学、脑影像学，以及精神障碍的流行病学调查、社区康复技术等。

7.皮肤病与性病学  皮肤病学是研究皮肤及其相关疾病的科学，主要研究各种皮肤及附属器相关疾病的病因、发病机制、临床表现、诊断、治疗和预防等，也包括正常皮肤及附属器的结构与功能；性病学是研究性传播疾病的科学，其内容包括各种性传播疾病的致病微生物、发病机制、临床表现、诊断、治疗和预防等。皮肤病与性病学的主要研究方向包括病毒性皮肤病、细菌性皮肤病、寄生虫皮肤病、代谢障碍性皮肤病、遗传性皮肤病、汗腺疾病、性传播性疾病、皮肤激光医学等。

8.影像医学与核医学  将核技术、电子计算机技术、影像技术和医学技术结合进行诊断、治疗和研究疾病，主要研究方向有放射诊断学和介入放射学，超声诊断学和介入超声学，核素诊断学和核素治疗学。

9.临床检验诊断学  主要采用实验室技术对来自机体的样本进行理化学、形态学、微生物学、分子生物学、遗传学、基因学、血药浓度等方面的研究和检验，为疾病的诊断、鉴别诊断、疗效判定和预后估计，以及疾病的预测等提供直接和间接的诊断依据。主要研究方向包括临床体液学、临床血液学、临床微生物学、临床生物化学、临床免疫学和临床分子生物学等。

10.妇产科学  是专门研究女性特有的生理、病理变化，以及生殖调控的一门临床学科，主要研究女性生殖器官疾病的病因、病理、诊断及防治，妊娠、分娩的生理和病理变化。包括 普通妇科学、妇科肿瘤学、围产医学（亦称围生医学）、女性生殖内分泌学、计划生育研究、妇女保健学等。

11.眼科学  主要研究发生在视觉系统，包括眼球及与其相关联组织的有关疾病的发生、发展和转归，以及预防、诊断和治疗。包括眼睑病、泪器病、眼表疾病、结膜病、巩膜病、玻璃体病、视网膜病、视神经病、斜视、近视等方向的研究。

12.耳鼻咽喉—头颈外科学  主要研究耳、鼻、咽喉、气管、食管及头颈部等相关疾病的病因、发病机制、临床表现、诊断、治疗与预防，以及人体听觉、平衡觉、嗅觉和呼吸、吞咽、发声、语言等器官和部分头颈部的解剖结构、生理功能。其主要研究方向包括耳鼻咽喉、气管、食管及其相关头颈区域外科学。

13.肿瘤学 主要研究肿瘤的病因、发病机制、病理、临床表现、诊断与鉴别诊断、治疗与多学科治疗、转归和预防。包括肿瘤免疫学、肿瘤病因学、肿瘤病理学、分子肿瘤学、肿瘤诊断学、肿瘤治疗学、肿瘤预防学、实验肿瘤学、肿瘤遗传学等。

14.康复医学与理疗学  是一门研究病、伤、残者康复的医学应用学科，其研究对象为伤 病所造成的功能障碍和能力受限的病、伤、残者，以及老年人当中的活动功能受限者。包括基础康复学、康复残疾学、临床康复评定学和临床康复治疗学等。

15.运动医学  主要研究与体育运动有关的医学问题，是医学与体育运动相结合的综合性应用科学。包括运动医务监督、运动损伤、运动营养学、运动康复和医疗体育等。

16.麻醉学  主要研究临床麻醉、生命机能调控、器官功能保护、重症监测治疗和疼痛诊疗的科学，贯穿于围手术期或急救过程中，全面参与为临床提供人性化医疗的环节中。包括麻醉生理学、麻醉药理学、麻醉应用解剖学等。

17.急诊医学  是给健康危急者提供全面、紧急和便捷的医疗服务，以避免死亡和残伤的发生，贯穿在院前急救、院内急诊、危重病监护、灾害救援过程中的相关理论和技能。包括心肺脑复苏、创伤急救、急性中毒、休克、多器官功能障碍、神经系统急症、环境因素所致急症、急危重症患者的代谢调节与营养支持等。

18.疼痛医学  是研究慢性顽固性痛的病因、发病机理、病程特点、发展与转归、诊断及治疗和预防等的科学。主要研究方向包括组织损伤性痛、内脏痛、头面部痛、神经损伤性痛、特殊痛等的诊疗。