植物保护学科以农业有害生物为研究对象，主要研究植物病原物、植物害虫、农田杂草、农业害鼠等农业有害生物的种类识别、生物学生态学特性、发生、为害、迁飞、扩散、入侵、成灾的规律与机理，预防与控制的策略与技术。作为农学门类中五个与种植业有关的一级学科之一，与作物学、园艺学、农业资源与环境及草学等一级学科有十分密切的联系；同时与生命科学领域中大多数学科方向(动物学、植物学、生理学、微生物学、遗传学、细胞生物学、分子生物学、生物化学、生物物理学等)以及生态学交叉。此外，系统科学和理学中的数学、物理学、工学中的化学工程与技术等学科的基础知识，在植物保护理论与技术创新中也是不可缺少的。在植物保护学科中，植物病理学和昆虫学分别在群体、个体、细胞、分子水平上研究有害生物发生发展及成灾规律，为有害生物治理提供基础，农药学的研究为有害生物的治理提供有力的武器。在植物保护学科中，目前最重要的理论就是有害生物综合治理理论，这个理论是人类与农业有害生物长期斗争中总结出来的，包含了无数成功的经验与失败的教训，是指导植物保护的研究与实践不断取得突破与成功的最重要基础。