动物遗传育种与繁殖学科为省级二级重点学科、二级硕士学位授权学科。
　　本学科2003年获得硕士学位授予权，2004年9月开始招收硕士研究生，2005年，获得校级重点学科，2006年本学科所在的畜牧一级学科被批准为一级硕士授权点。
　　目前，本学科是省级重点学科，依托本学科有畜牧学一级硕士授权点、畜牧学博士后科研流动站、国家动物科学实验教学示范中心、农业部动物生长发育调控重点实验室、河南省畜禽育种与生产工程重点实验室（培育基地）等教学科研平台。学科现有实验室面积2700平方米，实验动物房舍面积8400平米，实验设备170件，价值1320多万元。
        本学科现有成员27人，其中教授9人，副教授12人；博士14人，硕士6人；45岁以下16人。成员中中原学者1人、国家农业产业技术体系岗位科学家2人、全国专业学会副理事长人，省级专业学会理事长4人。学科梯队成员职称结构、年龄结构、学历结构合理，社会影响较大。
　　科学研究方面，先后主持包括国家自然科学基金、国家科技支持计划、国家农业产业技术体系岗位专家、河南省杰出人才基金、河南省杰出青年基金等等国家及省部级项目53项，总经费3800余万元。建立了含27个特色品种的鸡种质资源库(国内两大基因库之一)；围绕地方鸡种质资源发掘创新获授权国家技术发明专利28项，占国内本领域30.8%；主持培育了地方鸡新品系13个和豫南黑猪配套系2个，创建12套制种与配套应用模式；提出了保留良种黄牛基因的回交杂交复合育种技术体系，培育出豫粉蛋鸡1号、三高青脚黄鸡3号、豫南黑猪、夏南牛等国审品种4个；国际上提出了杂合型雌鼠配子形成中卵子细胞质合成“等位基因排斥作用”调控假说，首次报道了小鼠DDK品系与其他亚种品系之间的精卵亲和关系。
　　本学科立足于河南省优良品种的研究、培育与合理利用，以实现优质高效畜禽生产的可持续发展为目标，形成了四个具有特色和优势的研究方向：
　  （1）畜禽遗传资源保护与利用：对主要畜禽品种的种质特性进行系统研究，结合遗传标记技术和数量性状遗传方法，研究地方品种的优良特性，进行遗传评价与保存；针对畜产品消费市场的需求，以地方品种资源为基础，开展畜禽种质资源的持续利用；结合优质特色绿色产品开发，建立地方品种保存和利用的新机制，对地方畜禽种质资源的创新等进行研究。
　  （2）畜禽育种与集约化生产：主要运用数量遗传学选种方法，辅以生化、分子遗传标记辅助选择技术，进行畜禽新品系（品种）选育；综合运用数量遗传学、分子遗传学及现代育种技术，开展畜禽的杂交育种；针对选育出的新品种（系），从保护动物福利、充分发挥其生产潜力及满足人民对优质绿色动物食品的需求，开展畜禽新品种（系）集约化生产新工艺与新技术等方向的研究。
　  （3）动物生殖调控与胚胎工程：主要研究地方优良品种资源的繁殖规律和生理机制，并且应用于集约化生产的繁殖体系；研究动物配子发生、受精及早期胚胎发生、发育的机理；以及研究动物胚胎工程新技术。
　  （4）动物分子遗传与育种：主要研究动物重要性状分子遗传学基础和分子标记辅助选择研究；动物品种的DNA多态性研究，候选基因分析；动物重要性状主效基因的检测与利用研究；转基因技术在动物新品种培育上的应用研究。